2021年5月5日,《自然》(Nature)官網發表了題為“Why some researchers oppose unrestricted sharing of coronavirus data”的新聞,報道了目前科研領域學者關于新冠病毒數據共享方式的討論。文章概要如下:
世界各地的研究人員正在競相監測新型冠狀病毒(以下簡稱新冠病毒)的變異,以便確定變異的病毒是否會使疫苗失效,或使COVID-19更加致命。新冠病毒數據的全球共享對于加速其研究及醫學轉化至關重要。
目前,最受歡迎的新冠病毒基因組序列存儲庫是全球共享流感數據倡議組織(GISAID)的EpiCoV?數據庫。截至5月4日,該數據庫所存儲的全球新冠病毒基因組序列總量已達到140萬條。GISAID的數據共享模式采取了嚴格的保護機制,要求用戶必須登錄,且在使用他人共享的數據時說明其來源,并尋求與數據遞交者建立合作。
然而,GISAID采用的這一模式也引發了一些科研人員的不同意見。早前歐洲生物信息學研究所(EMBL-EBI)發布了一封在線信函,呼吁研究人員將新冠病毒數據放入公有領域(如存入INSDC數據庫)。這些數據將免費永久開放,獲取時不要求登錄,且對其使用無任何限制。截至5月4日,778名科研人員簽名支持這一倡議,但這些支持者有99%來自歐洲、美國和加拿大。
越來越多的研究人員(大多來自發達國家)支持將新冠病毒數據無限制地公開。他們表示這將使得大量數據跨越不同數據庫無縫流通,整合起來進行大規模的計算分析,從而更快地產出成果。
而一些來自資源欠缺的國家的研究人員則支持GISAID的數據共享模式。GISAID針對數據使用的限制條件有利于保障數據所有者在其數據產生科研成果后的權益。對新冠病毒基因組序列進行大數據分析會帶來成果發表,進而可能帶來研究資金支持和技術專利,如診斷檢測和疫苗的研發。如果沒有GISAID數據保護機制的限制,發展中國家的數據所有者可能因為擔心其數據被他人不公平地利用,而選擇待自家的成果正式發表后再公開數據,這將使數據的共享顯著延遲。
在這一問題上,EMBL-EBI聯合主任Rolf Apweiler對緊盯著中低收入國家情況的態度表示了疑義,因為它們貢獻的數據量相對較少。例如非洲向GISAID上傳了約13,000條序列,南美洲上傳了14,000條序列,而僅英國就上傳了約38萬條。但也有人指出,隨著COVID-19在歐洲和美國的發病率下降,危險的變異更可能出現在缺乏疫苗的中低收入國家,因而這些地方的數據對疫情應對必不可少。一些研究人員表示如果GISAID不為數據存儲者提供保護,共享的數據可能反而會減少。
注:文中信息來自Nature新聞原文,不代表本機構觀點或立場。
原文鏈接: https://www.nature.com/articles/d41586-021-01194-6
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